Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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SGCBQ16585 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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SGCBQ16585 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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