Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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