Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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