Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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SSX1Q16384 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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SSX1Q16384 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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SSX1Q16384 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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SSX1Q16384 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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SSX1Q16384 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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SSX1Q16384 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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SSX1Q16384 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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SSX1Q16384 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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SSX1Q16384 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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