Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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