Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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