Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 RN7SL677P-201ENST00000466970 319 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AP001107.9-202ENST00000531602 613 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AL137077.1-201ENST00000442115 528 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC020909.3-201ENST00000598194 375 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC112702.1-201ENST00000623712 366 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 ANAPC15-201ENST00000227618 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 TSEN15P3-201ENST00000422363 367 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 LINC00271-202ENST00000436554 655 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 SMCO4-202ENST00000525141 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 RN7SL624P-201ENST00000580297 278 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC023590.1-202ENST00000366457 781 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC159540.1-201ENST00000422600 555 ntTSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 PPP3CB-AS1-201ENST00000422977 930 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 LANCL1-203ENST00000431941 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC245369.8-201ENST00000636589 306 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 SH3GLB2-206ENST00000417224 1468 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 OR6N1-201ENST00000335094 1027 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC022424.2-201ENST00000514848 454 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC116914.2-201ENST00000571741 291 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 MIR22HG-206ENST00000573127 899 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 MIR378I-201ENST00000582688 76 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 SOX2-OT-228ENST00000597828 864 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 PSMG3-AS1-207ENST00000612019 586 ntTSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC106017.1-201ENST00000428348 440 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC007952.3-201ENST00000442355 440 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC007952.8-202ENST00000495691 440 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC142381.4-201ENST00000566806 702 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC142086.5-201ENST00000567619 702 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC104521.1-201ENST00000598582 279 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 C17orf98-201ENST00000614158 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 DEGS1-202ENST00000391877 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 KIR2DL4-203ENST00000357494 1396 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms