Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
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