Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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KCNB1Q14721 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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KCNB1Q14721 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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KCNB1Q14721 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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KCNB1Q14721 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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KCNB1Q14721 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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KCNB1Q14721 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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KCNB1Q14721 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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KCNB1Q14721 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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KCNB1Q14721 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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KCNB1Q14721 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
KCNB1Q14721 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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