Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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TRIM25Q14258 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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TRIM25Q14258 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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TRIM25Q14258 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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TRIM25Q14258 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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TRIM25Q14258 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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TRIM25Q14258 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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TRIM25Q14258 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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TRIM25Q14258 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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TRIM25Q14258 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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TRIM25Q14258 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
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