Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms