Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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