Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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IRF5Q13568 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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