Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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