Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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AP3B2Q13367 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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AP3B2Q13367 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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AP3B2Q13367 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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AP3B2Q13367 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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AP3B2Q13367 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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AP3B2Q13367 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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