Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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