Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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