Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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