Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms