Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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PTPRJQ12913 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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PTPRJQ12913 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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PTPRJQ12913 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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PTPRJQ12913 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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PTPRJQ12913 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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PTPRJQ12913 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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PTPRJQ12913 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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PTPRJQ12913 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.5 ms