Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms