Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC1Q08554 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms