Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms