Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms