Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP1Q00587 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms