Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms