Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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