Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-24P63145 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms