Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPL23P62829 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms