Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms