Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms