Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF10P55107 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
GDF10P55107 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF10P55107 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 480.7 ms