Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PGGT1BP53609 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PGGT1BP53609 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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PGGT1BP53609 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PGGT1BP53609 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PGGT1BP53609 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PGGT1BP53609 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PGGT1BP53609 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PGGT1BP53609 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PGGT1BP53609 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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PGGT1BP53609 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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