Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC3P51654 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms