Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ME1P48163 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ME1P48163 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ME1P48163 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ME1P48163 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ME1P48163 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ME1P48163 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ME1P48163 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ME1P48163 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ME1P48163 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ME1P48163 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ME1P48163 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ME1P48163 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ME1P48163 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ME1P48163 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ME1P48163 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ME1P48163 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ME1P48163 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ME1P48163 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ME1P48163 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ME1P48163 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ME1P48163 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ME1P48163 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ME1P48163 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ME1P48163 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ME1P48163 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ME1P48163 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ME1P48163 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ME1P48163 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ME1P48163 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ME1P48163 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ME1P48163 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ME1P48163 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ME1P48163 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ME1P48163 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms