Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms