Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5OP48047 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms