Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms