Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCG1P45844 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms