Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms