Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJC1P36383 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJC1P36383 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJC1P36383 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJC1P36383 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJC1P36383 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJC1P36383 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJC1P36383 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJC1P36383 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJC1P36383 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJC1P36383 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJC1P36383 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJC1P36383 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJC1P36383 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJC1P36383 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJC1P36383 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJC1P36383 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJC1P36383 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJC1P36383 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GJC1P36383 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJC1P36383 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJC1P36383 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJC1P36383 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJC1P36383 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJC1P36383 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJC1P36383 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJC1P36383 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJC1P36383 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJC1P36383 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJC1P36383 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJC1P36383 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJC1P36383 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJC1P36383 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJC1P36383 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJC1P36383 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJC1P36383 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJC1P36383 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJC1P36383 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJC1P36383 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJC1P36383 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJC1P36383 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJC1P36383 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GJC1P36383 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
GJC1P36383 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GJC1P36383 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GJC1P36383 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJC1P36383 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJC1P36383 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJC1P36383 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJC1P36383 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJC1P36383 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJC1P36383 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJC1P36383 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJC1P36383 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GJC1P36383 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJC1P36383 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJC1P36383 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJC1P36383 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GJC1P36383 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJC1P36383 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJC1P36383 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GJC1P36383 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJC1P36383 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJC1P36383 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJC1P36383 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJC1P36383 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJC1P36383 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJC1P36383 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJC1P36383 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJC1P36383 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJC1P36383 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJC1P36383 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJC1P36383 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJC1P36383 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJC1P36383 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJC1P36383 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms