Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms