Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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