Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRMP28827 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRMP28827 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRMP28827 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPRMP28827 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRMP28827 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRMP28827 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRMP28827 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRMP28827 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRMP28827 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPRMP28827 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRMP28827 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRMP28827 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRMP28827 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRMP28827 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRMP28827 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRMP28827 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRMP28827 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRMP28827 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRMP28827 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRMP28827 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRMP28827 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRMP28827 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRMP28827 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRMP28827 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRMP28827 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRMP28827 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRMP28827 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRMP28827 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRMP28827 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRMP28827 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRMP28827 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRMP28827 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRMP28827 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRMP28827 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRMP28827 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRMP28827 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRMP28827 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRMP28827 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRMP28827 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRMP28827 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRMP28827 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRMP28827 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRMP28827 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRMP28827 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRMP28827 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRMP28827 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRMP28827 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRMP28827 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRMP28827 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRMP28827 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRMP28827 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRMP28827 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRMP28827 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRMP28827 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRMP28827 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRMP28827 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRMP28827 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPRMP28827 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRMP28827 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRMP28827 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRMP28827 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPRMP28827 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRMP28827 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRMP28827 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPRMP28827 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRMP28827 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRMP28827 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRMP28827 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRMP28827 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRMP28827 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRMP28827 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRMP28827 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRMP28827 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRMP28827 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRMP28827 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRMP28827 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRMP28827 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRMP28827 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRMP28827 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRMP28827 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRMP28827 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRMP28827 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRMP28827 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRMP28827 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRMP28827 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRMP28827 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRMP28827 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRMP28827 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRMP28827 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRMP28827 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRMP28827 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTPRMP28827 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRMP28827 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRMP28827 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRMP28827 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRMP28827 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRMP28827 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRMP28827 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRMP28827 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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