Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms