Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCM3P25205 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCM3P25205 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms