Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms