Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPREP23469 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPREP23469 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPREP23469 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPREP23469 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPREP23469 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPREP23469 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPREP23469 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPREP23469 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPREP23469 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPREP23469 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPREP23469 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPREP23469 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPREP23469 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPREP23469 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPREP23469 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPREP23469 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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