Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRHP20396 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRHP20396 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRHP20396 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRHP20396 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRHP20396 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRHP20396 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRHP20396 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRHP20396 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRHP20396 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRHP20396 SFTPA2-202ENST00000372327 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRHP20396 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRHP20396 KRTAP10-12-201ENST00000400365 873 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRHP20396 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRHP20396 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRHP20396 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRHP20396 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRHP20396 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRHP20396 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRHP20396 TRPM1-210ENST00000559179 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRHP20396 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRHP20396 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRHP20396 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRHP20396 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRHP20396 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRHP20396 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRHP20396 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRHP20396 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRHP20396 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRHP20396 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRHP20396 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRHP20396 AC124944.3-201ENST00000607976 1304 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRHP20396 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRHP20396 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRHP20396 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRHP20396 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRHP20396 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRHP20396 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRHP20396 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRHP20396 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRHP20396 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRHP20396 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRHP20396 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRHP20396 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRHP20396 RIBC1-203ENST00000414955 1281 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRHP20396 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRHP20396 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRHP20396 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRHP20396 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRHP20396 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRHP20396 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRHP20396 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRHP20396 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRHP20396 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRHP20396 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRHP20396 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRHP20396 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRHP20396 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRHP20396 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRHP20396 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRHP20396 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRHP20396 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRHP20396 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRHP20396 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRHP20396 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRHP20396 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRHP20396 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRHP20396 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRHP20396 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRHP20396 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRHP20396 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRHP20396 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRHP20396 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRHP20396 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRHP20396 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRHP20396 DDIAS-204ENST00000525388 961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRHP20396 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRHP20396 AL139317.2-201ENST00000556998 158 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRHP20396 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRHP20396 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRHP20396 PPY-202ENST00000587006 431 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRHP20396 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRHP20396 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRHP20396 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRHP20396 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRHP20396 MBIP-211ENST00000621657 1809 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRHP20396 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRHP20396 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRHP20396 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRHP20396 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRHP20396 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRHP20396 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRHP20396 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRHP20396 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRHP20396 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRHP20396 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRHP20396 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRHP20396 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRHP20396 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRHP20396 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms