Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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CXCL3P19876 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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CXCL3P19876 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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CXCL3P19876 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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CXCL3P19876 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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CXCL3P19876 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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